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簡要描述:scanR篩選工作站將基于顯微鏡設(shè)置的模塊化和靈活性與高內(nèi)涵篩選需求的自動化、速度和效率相結(jié)合。模塊化設(shè)計適合標準分析和分析開發(fā),讓scanR工作站適用于研發(fā)應(yīng)用或多用戶環(huán)境。
靈活的模塊化硬件
scanR篩選工作站將基于顯微鏡設(shè)置的模塊化和靈活性與高內(nèi)涵篩選需求的自動化、速度和效率相結(jié)合。模塊化設(shè)計適合標準分析和分析開發(fā),讓scanR工作站適用于研發(fā)應(yīng)用或多用戶環(huán)境。
綜合性軟件
scanR解決方案靈活開放的設(shè)計讓其成為日常和*級應(yīng)用的有效工具。其旨在滿足現(xiàn)代細胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、1.系統(tǒng)生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的定量成像和圖像分析要求。
2.生物樣品的全自動圖像采集和數(shù)據(jù)分析
3.針對多孔板、載玻片和定制陣列而設(shè)計
4.用于生物功能測定的強大分析模塊
5.適合分析開發(fā)和高內(nèi)涵篩選
6.可用于固定細胞和活細胞
分析示例
在藥*發(fā)現(xiàn)篩選中,已建立的協(xié)議可用于顯示化合物在細胞水平的生物化學(xué)作用。可以利用一系列標準化分析準確評估基因表達水平的藥*誘導(dǎo)變化。scanR解決方案在測量細胞凋亡、微核或DNA片段化(彗星試驗)的常規(guī)篩選方面表現(xiàn)出色,并涵蓋了許多研究領(lǐng)域的各種篩選應(yīng)用。
·細胞計數(shù)
·基因表達
·細胞內(nèi)運輸
·易位
·細胞增殖
·早幼粒細胞白血病(PML)身體測定
·細菌和病毒感染試驗
·細胞周期分析
·細胞陣列篩選
·蛋白質(zhì)定位和共定位
·包括動力學(xué)分析以及對所得響應(yīng)曲線圈門的活細胞測定
·多色分析
·稀有事件分析
·自動FISH分析
·組織切片中的熒光分析
·細胞遷移
靈活的模塊選項
scanR的設(shè)計不僅滿足全自動高內(nèi)涵篩選系統(tǒng)的特定速度、耐久性和可靠性要求,還具備無y倫b的靈活性和適應(yīng)性以及廣泛的擴展能力。這些讓scanR能夠匹配任何應(yīng)用和預(yù)算的規(guī)范要求。其他選項列表包括諸如基于深度學(xué)習(xí)技術(shù)的自主學(xué)習(xí)顯微鏡模塊、使用動力學(xué)模塊測量動力學(xué)參數(shù)的模塊、高速3D反卷積模塊、基于IX83的紅外(IR)激光硬件自動聚焦的集成ZDC等等。
圈門和分類
1.基于流式的強大數(shù)據(jù)分析概念已成功應(yīng)用于大圖像數(shù)據(jù)集分析的需求。
2.多維圖像數(shù)據(jù)以二維散點圖或一維直方圖顯示;可使用圖形工具選擇感興趣的聚類數(shù)據(jù)群
3.來自不同散點圖的圈門可以與布爾運算組合創(chuàng)建復(fù)雜分類方案
分層圈門方法可以直觀地選擇群,也可以直接畫廊展示。
目標檢測與分析
1.強大的目標檢測模塊可以分割細胞核、細胞或其他結(jié)構(gòu)
2.選擇多種檢測算法并根據(jù)感興趣的目標進行調(diào)整
3.基于分割結(jié)果,可從超過100個目標參數(shù)列表中選擇所要提取的特征
4.助力各類基于細胞的分析
下面圖像截屏詳細說明了scanR采集數(shù)據(jù)后對圖像的檢測和分割。由德國海德堡EMBL R. Pepperkok博士提供。
即時質(zhì)量控制
1.圖像和目標與其相關(guān)數(shù)據(jù)點相互關(guān)聯(lián):
2.單擊數(shù)據(jù)點則會在顯示窗口中加載相關(guān)圖像并突出顯示相關(guān)對象
3.單擊圖像顯示窗口中的對象可突出顯示散點圖和直方圖中的相關(guān)數(shù)據(jù)點
4.創(chuàng)建門控數(shù)據(jù)群或選定的所有圖像的圖庫視圖,從而便于將大圖像集與相關(guān)信息進行直接、可視化的比較
結(jié)果會在熱圖中可視化顯示或輸出到表格中。顯示全孔概覽非常簡單。
用動力學(xué)模塊測量動力學(xué)參數(shù)
1.可以通過時間變量對活細胞、細胞核和其他目標進行分類
2.根據(jù)隨著時間推移測量的值(諸如強度、面積、比率、形狀因子等平均靜態(tài)參數(shù))評估跟蹤曲線
3.隨著時間變化評估和分析諸如強度或熒光標記強度、位置、大小或形狀等靜態(tài)參數(shù)
4.曲線濃縮為單一特征值(動力學(xué)參數(shù))
5.在1D或2D直方圖中繪制動力學(xué)參數(shù),并根據(jù)其特定的時間變量繪制門群
表達FUCC(CA)生物傳感器的hES細胞。由英國倫敦弗朗西斯克里克研究所Silvia Santos博士提供。
兩個系統(tǒng)的故事
1.在與scanR解決方案相同的系統(tǒng)上運行奧林巴斯cellSens活細胞成像軟件,您就可以同時使用相同的設(shè)置進行篩選和*端成像
2.利用2D和3D約束迭代反卷積算法,為苛刻的篩選應(yīng)用獲取接近共焦品質(zhì)的圖像細節(jié)
3.快速且便利的算法可以消除離焦模糊以及背景,從而突出重要的結(jié)構(gòu)細節(jié)
4.有助于進行要求高分辨率結(jié)構(gòu)細節(jié)的深度分析
自主學(xué)習(xí)顯微鏡
經(jīng)過*次性培訓(xùn)階段之后,scanR AI能夠讓系統(tǒng)通過將所學(xué)習(xí)的分析協(xié)議整合到基于分析的工作流中實現(xiàn)新數(shù)據(jù)的自動分析。由于用戶在訓(xùn)練實驗的設(shè)計上掌握*全控制權(quán),并且在訓(xùn)練階段可以加入許多具有挑戰(zhàn)性的分析條件,因此提高了分析結(jié)果的準確性和魯棒性。所學(xué)到的AI分析協(xié)議可以通過軟件*有的數(shù)據(jù)探索和分析界面進行深入、輕松的驗證,確保您對AI結(jié)果充滿信心。
使用自主學(xué)習(xí)顯微鏡生成的AI模型對無熒光染色的明場圖形進行分析。Hela細胞的細胞核在訓(xùn)練階段進行GFP標記,以此顯示系統(tǒng)如何對明場圖像進行分析。一種*新思維方式自主學(xué)習(xí)顯微鏡為高內(nèi)涵分析拓展了*新的視野。應(yīng)用范圍涵蓋了從以前不可能完成的圖像分割任務(wù)到極低信號水平的定量分析、簡化染色方案、無標記分析等。
應(yīng)用示例:在不同信號水平下對細胞核的強大分割,能夠大幅減少定量分析的曝光量。
技術(shù)參數(shù)
項目 | 參數(shù) |
---|---|
scanR篩選系統(tǒng) | 基于顯微鏡的生命科學(xué)應(yīng)用篩選系統(tǒng)平臺 靈活性:可根據(jù)應(yīng)用要求*確調(diào)整系統(tǒng)配置 性能和耐用性:*端系統(tǒng)整合理念,實時部件并聯(lián)運行,使得滿足高通量篩選應(yīng)用的平臺開放性和可靠性優(yōu)勢合二為一 滿足篩選應(yīng)用的吞吐量和可靠性需求 |
顯微鏡鏡架 | 奧林巴斯倒置*端顯微鏡IX83,單層或雙層機架 電動載物臺, 適用于IX83的MarzhauserSCAN IM 120 x 80 |
熒光LED選項 |
Lumencor SpectraX: 6個獨立的LED通道 CoolLED pE-300ultra: 3個獨立的LED通道 針對應(yīng)用優(yōu)化的帶通濾光片 壽命> 20,000小時 |
透射光 照明選項 |
透射照明僅用于目視觀察(無透射光篩選) 適用于篩選和目視觀察的透射光照明,包括快門(支持透射光篩選) 可選DIC(微分干涉)或相襯觀察 |
硬件控制以及 系統(tǒng)同步 |
帶有單獨CPU的實時控制器,獨立于成像PC計算機的操作系統(tǒng) 時間分辨率: 1毫秒 計時精度: < 0.01毫秒 硬件同步多任務(wù)采集(照明控制、發(fā)射濾光片、快門等) 通過外部觸發(fā)器*確控制相機 |
相機選項 | Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 V3,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高靈敏度冷卻sCMOS相機 Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 LT PLUS,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高性價比sCMOS相機 Hamamatsu ORCA R2,高靈敏度冷卻CCD相機 Hamamatsu C8484,高靈敏度CCD相機 |
物鏡選項 | “薄”底(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(2x,4x,10x,20x,40x,60x,100x)的物鏡 “厚”底(~1 mm)厚度的塑料底板和載玻片(2x,4x,10x,20x,40x,60x)的物鏡 “薄”底的(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 “厚”底的(~1 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 |
濾光片組 | 單帶通濾光片組(根據(jù)要求提供規(guī)格) 多帶通濾光片組(根據(jù)要求提供規(guī)格) |
scanR系統(tǒng) 軟件 |
2個獨立軟件模塊:scanR采集軟件和scanR分析軟件 陰影校準流程,彌補采集時或采集后的陰影并優(yōu)化局部熒光強度的均勻性 軟件模塊可以安裝在相同或不同的工作站上(64位Windows 10系統(tǒng) ) |
scanR采集 軟件 |
面向工作流的配置和用戶界面 功能強大的軟件自動對焦程序可與選配紅外激光硬件自動對焦功能、二步粗和細自動對焦、基于對象的自動對焦或基于圖像的自動對焦結(jié)合使用 具有預(yù)定義格式(載玻片、多孔板)的板管理器,和用于創(chuàng)建和編輯自定義格式(斑點陣列)的編輯界面 用于補償陰影并優(yōu)化空間強度均勻性的陰影校正 時間序列篩選,Z-stack篩選,多色篩選(無限量的采集通道) 支持集成到自動化樣品制備線中,例如用于液體處理的腳本化接口 |
scanR分析 軟件 |
用于標準測定和測定開發(fā)的自動化圖像和數(shù)據(jù)分析 在線和離線多核分析 圖像處理、圖像分析、顆粒檢測、參數(shù)提取和計算 細胞計數(shù)數(shù)據(jù)探索、分析、圈門和分類 強大靈活的圈門概念 ,包括自動化群檢測等 數(shù)據(jù)點、對象和圖像之間的直接關(guān)聯(lián) 基于分析的工作流和先進的科學(xué)分析開發(fā)功能 |
計算機 | 成像計算機(*新*代PC計算機),64位Windows 7 操作系統(tǒng) |
其他選項 | scanR AI深度學(xué)習(xí)解決方案 延時動力學(xué)分析模塊 - 一種*特的細胞計數(shù)方法,可以更好地分析和了解活細胞動力學(xué) 3D反卷積模塊(需要64位操作系統(tǒng)) 配有一個或兩個攝像頭的Yokogawa®CSU-W1®共聚焦選項 兩個攝像頭同時采集 基于奧林巴斯IX83顯微鏡系列ZDC的紅外激光硬件自動對焦功能 cellVivo孵育系統(tǒng) 板載機器人 編碼變倍器IX3-CAS 用于“Sedat”配置高速成像的快速發(fā)射濾光片轉(zhuǎn)盤(FFWO) 定制:硬件、軟件、分析 其他scanR分析工作站 scanR分析軟件的第er個許可證 |
一套設(shè)置包含2個系統(tǒng) | 可與cellSens活細胞成像軟件結(jié)合使用,從而實現(xiàn)*端成像系統(tǒng)的q面通用性 |
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